MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS6

Total Repeats: 607

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019436	TAT	2	6	6	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075269
2	NC_019436	TGAA	2	8	41	48	50 %	25 %	25 %	0 %	414075269
3	NC_019436	ATA	2	6	74	79	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075269
4	NC_019436	ATA	2	6	173	178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075269
5	NC_019436	ATCT	2	8	181	188	25 %	50 %	0 %	25 %	414075269
6	NC_019436	A	7	7	192	198	100 %	0 %	0 %	0 %	414075269
7	NC_019436	ATT	2	6	201	206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075269
8	NC_019436	T	7	7	210	216	0 %	100 %	0 %	0 %	414075269
9	NC_019436	AAG	2	6	251	256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075269
10	NC_019436	T	7	7	282	288	0 %	100 %	0 %	0 %	414075269
11	NC_019436	AGA	2	6	297	302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075269
12	NC_019436	A	7	7	302	308	100 %	0 %	0 %	0 %	414075269
13	NC_019436	ATG	3	9	368	376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075269
14	NC_019436	TAT	2	6	399	404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075269
15	NC_019436	TGAT	2	8	413	420	25 %	50 %	25 %	0 %	414075269
16	NC_019436	TCTTA	2	10	483	492	20 %	60 %	0 %	20 %	414075269
17	NC_019436	A	6	6	669	674	100 %	0 %	0 %	0 %	414075269
18	NC_019436	AGA	2	6	681	686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075269
19	NC_019436	A	6	6	730	735	100 %	0 %	0 %	0 %	414075269
20	NC_019436	GAA	2	6	771	776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075269
21	NC_019436	GAT	2	6	787	792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075269
22	NC_019436	TTA	2	6	859	864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075269
23	NC_019436	CTA	2	6	898	903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075269
24	NC_019436	AGA	2	6	965	970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075269
25	NC_019436	AAG	2	6	1055	1060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075269
26	NC_019436	A	6	6	1093	1098	100 %	0 %	0 %	0 %	414075269
27	NC_019436	CTAC	2	8	1114	1121	25 %	25 %	0 %	50 %	414075269
28	NC_019436	TGAG	2	8	1144	1151	25 %	25 %	50 %	0 %	414075269
29	NC_019436	GAA	2	6	1224	1229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075270
30	NC_019436	TAG	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075270
31	NC_019436	AT	3	6	1298	1303	50 %	50 %	0 %	0 %	414075270
32	NC_019436	GTT	2	6	1304	1309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075270
33	NC_019436	ACA	2	6	1313	1318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075270
34	NC_019436	AAC	2	6	1408	1413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075270
35	NC_019436	CAA	3	9	1485	1493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075270
36	NC_019436	A	6	6	1512	1517	100 %	0 %	0 %	0 %	414075270
37	NC_019436	AGA	2	6	1523	1528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075270
38	NC_019436	AGG	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414075270
39	NC_019436	A	6	6	1581	1586	100 %	0 %	0 %	0 %	414075270
40	NC_019436	AATC	2	8	1590	1597	50 %	25 %	0 %	25 %	414075270
41	NC_019436	GAA	2	6	1602	1607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075270
42	NC_019436	ATAAA	2	10	1645	1654	80 %	20 %	0 %	0 %	414075270
43	NC_019436	AAT	2	6	1671	1676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075270
44	NC_019436	A	6	6	1686	1691	100 %	0 %	0 %	0 %	414075270
45	NC_019436	ACAG	2	8	1826	1833	50 %	0 %	25 %	25 %	414075271
46	NC_019436	CAAGA	2	10	1878	1887	60 %	0 %	20 %	20 %	414075271
47	NC_019436	GGA	2	6	1893	1898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414075271
48	NC_019436	AGA	2	6	1921	1926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075271
49	NC_019436	A	6	6	1943	1948	100 %	0 %	0 %	0 %	414075271
50	NC_019436	TCA	3	9	2306	2314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075272
51	NC_019436	T	7	7	2339	2345	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
52	NC_019436	TA	3	6	2403	2408	50 %	50 %	0 %	0 %	414075272
53	NC_019436	ATC	2	6	2422	2427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075272
54	NC_019436	TGT	2	6	2491	2496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075272
55	NC_019436	TGT	2	6	2540	2545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075272
56	NC_019436	GTTTGA	2	12	2646	2657	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414075272
57	NC_019436	CTTTGT	2	12	2693	2704	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414075272
58	NC_019436	T	7	7	2754	2760	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
59	NC_019436	TAA	2	6	2790	2795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075272
60	NC_019436	TTTCTT	2	12	2943	2954	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	414075272
61	NC_019436	CTTT	2	8	2972	2979	0 %	75 %	0 %	25 %	414075272
62	NC_019436	TTTC	2	8	3026	3033	0 %	75 %	0 %	25 %	414075272
63	NC_019436	T	6	6	3071	3076	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
64	NC_019436	T	7	7	3093	3099	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
65	NC_019436	T	6	6	3136	3141	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
66	NC_019436	GTC	2	6	3145	3150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075272
67	NC_019436	GTTT	2	8	3225	3232	0 %	75 %	25 %	0 %	414075272
68	NC_019436	AAT	2	6	3273	3278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075272
69	NC_019436	GGAC	2	8	3308	3315	25 %	0 %	50 %	25 %	414075272
70	NC_019436	AAT	2	6	3316	3321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075272
71	NC_019436	TTTC	2	8	3357	3364	0 %	75 %	0 %	25 %	414075272
72	NC_019436	TGA	2	6	3389	3394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075272
73	NC_019436	ATTT	2	8	3396	3403	25 %	75 %	0 %	0 %	414075272
74	NC_019436	AAT	2	6	3472	3477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075272
75	NC_019436	ATC	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075272
76	NC_019436	T	7	7	3599	3605	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
77	NC_019436	T	6	6	3614	3619	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
78	NC_019436	TCA	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075272
79	NC_019436	TGAA	2	8	3664	3671	50 %	25 %	25 %	0 %	414075272
80	NC_019436	T	6	6	3714	3719	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
81	NC_019436	TCA	2	6	3726	3731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075272
82	NC_019436	GAA	2	6	3761	3766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075272
83	NC_019436	CTT	2	6	3842	3847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075273
84	NC_019436	T	6	6	3851	3856	0 %	100 %	0 %	0 %	414075273
85	NC_019436	ATT	2	6	3909	3914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075273
86	NC_019436	TGAT	2	8	3943	3950	25 %	50 %	25 %	0 %	414075273
87	NC_019436	GAA	2	6	3985	3990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075273
88	NC_019436	ATA	2	6	4000	4005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075273
89	NC_019436	A	6	6	4031	4036	100 %	0 %	0 %	0 %	414075273
90	NC_019436	ATT	2	6	4077	4082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075273
91	NC_019436	TTTC	2	8	4091	4098	0 %	75 %	0 %	25 %	414075273
92	NC_019436	ATC	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075273
93	NC_019436	T	6	6	4143	4148	0 %	100 %	0 %	0 %	414075273
94	NC_019436	TC	3	6	4158	4163	0 %	50 %	0 %	50 %	414075273
95	NC_019436	ATT	2	6	4174	4179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075273
96	NC_019436	TCAC	2	8	4295	4302	25 %	25 %	0 %	50 %	414075273
97	NC_019436	CTCAA	2	10	5099	5108	40 %	20 %	0 %	40 %	414075274
98	NC_019436	CAA	3	9	5125	5133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075274
99	NC_019436	A	6	6	5155	5160	100 %	0 %	0 %	0 %	414075274
100	NC_019436	ATA	2	6	5167	5172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075274
101	NC_019436	TGACAA	2	12	5243	5254	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414075274
102	NC_019436	ATA	2	6	5308	5313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075274
103	NC_019436	GTT	2	6	5392	5397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075274
104	NC_019436	TAA	2	6	5424	5429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075274
105	NC_019436	AC	3	6	5432	5437	50 %	0 %	0 %	50 %	414075274
106	NC_019436	ATAA	2	8	5454	5461	75 %	25 %	0 %	0 %	414075274
107	NC_019436	AAC	2	6	5494	5499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075274
108	NC_019436	TAA	2	6	5514	5519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075274
109	NC_019436	TCG	2	6	5612	5617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075274
110	NC_019436	CTG	2	6	5647	5652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075274
111	NC_019436	AT	3	6	5662	5667	50 %	50 %	0 %	0 %	414075274
112	NC_019436	TTC	2	6	5834	5839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075275
113	NC_019436	TA	3	6	5849	5854	50 %	50 %	0 %	0 %	414075275
114	NC_019436	CGT	2	6	5923	5928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075275
115	NC_019436	TA	3	6	5996	6001	50 %	50 %	0 %	0 %	414075275
116	NC_019436	GCT	2	6	6112	6117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075275
117	NC_019436	TTTC	2	8	6129	6136	0 %	75 %	0 %	25 %	414075275
118	NC_019436	TCT	2	6	6257	6262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075275
119	NC_019436	GTA	2	6	6313	6318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075275
120	NC_019436	GTA	2	6	6387	6392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075275
121	NC_019436	AAT	2	6	6405	6410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075275
122	NC_019436	T	6	6	6417	6422	0 %	100 %	0 %	0 %	414075275
123	NC_019436	T	6	6	6496	6501	0 %	100 %	0 %	0 %	414075276
124	NC_019436	AAT	2	6	6672	6677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075276
125	NC_019436	CGG	2	6	6757	6762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414075276
126	NC_019436	TAAA	2	8	6963	6970	75 %	25 %	0 %	0 %	414075276
127	NC_019436	TAT	2	6	6992	6997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075276
128	NC_019436	ACT	2	6	7120	7125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075277
129	NC_019436	TAA	2	6	7126	7131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075277
130	NC_019436	TTG	2	6	7133	7138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075277
131	NC_019436	AATGA	2	10	7160	7169	60 %	20 %	20 %	0 %	414075277
132	NC_019436	TCA	2	6	7189	7194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075277
133	NC_019436	AAGAAA	2	12	7215	7226	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414075277
134	NC_019436	TAT	2	6	7237	7242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075277
135	NC_019436	ATC	2	6	7298	7303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075277
136	NC_019436	ATGC	2	8	7418	7425	25 %	25 %	25 %	25 %	414075277
137	NC_019436	CAG	2	6	7527	7532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414075277
138	NC_019436	TGG	2	6	7546	7551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414075277
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267	NC_019436	TTTC	2	8	15528	15535	0 %	75 %	0 %	25 %	414075284
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269	NC_019436	GTA	2	6	15712	15717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075284
270	NC_019436	GTA	2	6	15786	15791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075284
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300	NC_019436	ACT	2	6	17555	17560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075285
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303	NC_019436	A	6	6	17830	17835	100 %	0 %	0 %	0 %	414075285
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396	NC_019436	CCG	2	6	25696	25701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414075290
397	NC_019436	GCA	2	6	25888	25893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414075290
398	NC_019436	GTC	2	6	25995	26000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075290
399	NC_019436	GTC	2	6	26034	26039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075290
400	NC_019436	AGC	2	6	26131	26136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414075290
401	NC_019436	TCT	2	6	26141	26146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075290
402	NC_019436	ATTG	2	8	26171	26178	25 %	50 %	25 %	0 %	414075290
403	NC_019436	GCT	2	6	26269	26274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075290
404	NC_019436	CAT	3	9	26291	26299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075290
405	NC_019436	CTGC	2	8	26360	26367	0 %	25 %	25 %	50 %	414075290
406	NC_019436	ATC	2	6	26379	26384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075290
407	NC_019436	ACA	2	6	26401	26406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075290
408	NC_019436	CCGTGA	2	12	26471	26482	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	414075290
409	NC_019436	CCA	2	6	26515	26520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414075290
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411	NC_019436	GTA	2	6	26640	26645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075290
412	NC_019436	GTG	2	6	26665	26670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414075290
413	NC_019436	TTGATG	2	12	26767	26778	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414075290
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415	NC_019436	CTT	2	6	26951	26956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075290
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422	NC_019436	TCG	2	6	27280	27285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075290
423	NC_019436	TGT	2	6	27346	27351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075290
424	NC_019436	TGC	2	6	27360	27365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075290
425	NC_019436	TTG	2	6	27454	27459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075290
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428	NC_019436	TTTC	2	8	27639	27646	0 %	75 %	0 %	25 %	414075290
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430	NC_019436	CCG	3	9	27769	27777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414075290
431	NC_019436	TCA	2	6	27907	27912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075290
432	NC_019436	TGG	2	6	28016	28021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414075290
433	NC_019436	ATC	2	6	28038	28043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075290
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436	NC_019436	CAT	2	6	28211	28216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075290
437	NC_019436	ATA	2	6	28248	28253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075290
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439	NC_019436	CTG	2	6	28290	28295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075290
440	NC_019436	TGG	2	6	28328	28333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414075290
441	NC_019436	CTG	2	6	28336	28341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075290
442	NC_019436	ATA	2	6	28410	28415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075290
443	NC_019436	TA	3	6	28433	28438	50 %	50 %	0 %	0 %	414075290
444	NC_019436	GCC	2	6	28512	28517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414075290
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